Žaidime „Son Goku Vs Naruto“ turėsite dalyvauti mūšiuose tarp mėlynosios ir raudonosios komandos. Pasirinkę akistatos pusę, su komanda atsidursite starto zonoje. Naudodami valdymo klavišus priversite savo herojų judėti vietoje. Kai tik pastebėsite priešą, turėsite jį sugauti ir atidengti ugnį, kad nužudytumėte. Tiksliai šaudydami sunaikinsite savo priešininkus ir už tai gausite taškų žaidime Son Goku vs Naruto.