Po gamtos apokalipsės upės išsiliejo iš krantų, o miestų gatvės virto kanalais. Atėjo visiška anarchija, valdžia paralyžiuota, kiekvienas turi išgyventi kaip gali. Žaidimo „Hydro Storm 2“ herojui nėra svetima kova už gyvybę. Jis jau įsigijo greitąjį vandens paspirtuką ir yra pasirengęs atlikti bet kokias misijas.